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En el código Manchester Diferencial al igual que en el Manchester hay una transición en la mitad del intervalo; en este tipo de codificación, un bit de valor "1" se indica por la ausencia de transición al inicio del intervalo, mientras que un bit "0" se indica por la presencia de una transición en el inicio, existiendo siempre una transición en el centro del intervalo. La transición a la mitad de un bit se presenta para sincronizar al transmisor y al receptor. El esquema diferencial requiere un equipo más sofisticado, pero ofrece una mayor inmunidad al ruido.


Bit 0: la forma de la onda es idéntica a la del bit anterior
Bit 1: la forma de la onda es opuesta a la del bit anterior

La codificación Manchester diferencial tiene en cuenta el valor binario de la señal en el momento anterior.